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ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia

Genome Research · 2012

ChIP-seq/CUT&Tag/CUT&RUN 常用 peak calling 工具，用于定位蛋白-DNA 结合或组蛋白修饰区域。

NCBI 功能基因组数据仓库，收录 RNA-seq、芯片、甲基化、ChIP-seq 等项目。

Nature Communications · 2019

适合复杂设计和小样本 RNA-seq 的差异表达 R 包，提供 TMM 标准化和 GLM 框架。